高通量大尺度空间转录组解析系统: MetaScope
High-throughput Large-scale Spatial Transcriptome Analysis System

主要技术与性能指标

●基因通量:4—1 288基因(可个性化定制基因探针)  ●分辨率:亚细胞  ●组织要求:新鲜样本

●成像面积:直径为25 mm的圆形区域  ●组学:转录组和蛋白质组学  ●软件:配备全自动成像和分析软件

主要应用

在发育生物学、肿瘤免疫治疗、神经退行性疾病等领域具有广泛应用。它能精确揭示不同细胞类型在空间中的分布及基因表达差异,为研究胚胎发育、肿瘤免疫微环境及神经退行性疾病的分子机制提供重要信息。通过描绘细胞在组织中的空间位置和转录特征,有助于理解免疫反应、疾病进程及治疗效果。此外,空间转录组还在组织工程和再生医学中应用,帮助优化细胞治疗策略,为疾病治疗和精准医学提供新思路

代表性应用成果

在胶质母细胞瘤研究中的36个基因成像,以及在视网膜研究中的39个基因成像,展示了单细胞乃至亚细胞水平的基因表达差异,清晰地揭示了不同细胞类型的空间分布及其共定位关系。在小鼠大脑研究中,针对2个矢状面切片进行了涉及228个和1288个基因的多轮编码成像,使用一些已报道的差异基因可以有效地区分不同脑区。该技术对短RNA(如microRNA)也表现出了高灵敏度

主要用户单位 科研院所、空间组学服务公司
研制单位 中国科学技术大学
联系方式 戴老师  0551-63602270  dhdai@iai.ustc.edu.cn